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伊成器课题组聚焦新冠病毒共感染病原体的检测与研究

日期: 2020-05-02

目前,新型冠状病毒肺炎COVID-19疫情严峻,截至4月8日,全球已累计确诊近134万例,死亡超7万,对人类生存健康造成了严重的危害。新型冠状病毒肺炎COVID-19是由新型冠状病毒SARS-CoV-2感染导致的,而感染者除了典型的肺炎等呼吸系统症状外,还伴随多组织多器官的其他多种症状,其原因很可能是存在其他病原体的共感染或继发感染。确定共感染的病原体类型与症状之间的关系,对于对症治疗和用药指导尤为重要。但是如何做到对临床样品中共感染的多种病毒、细菌和真菌等病原体同时进行快速、无偏向性的检测呢?

河北快3app伊成器课题组新近发展的基于转座酶的TRACE (Transposase assisted RNA/DNA hybrid Co-tagmEntation)建库测序技术,能够快捷地检测与新冠病毒共感染的潜在病原体。TRACE技术不同于繁琐、耗时久的传统RNA-seq建库流程,所有步骤均在一个试管中完成,建库总时长小于6小时,操作时长不超过2小时,将原来需要数天完成的程序降低到半天;同时,TRACE技术能够避免RNA材料的损失,缩小RNA起始量至纳克级别,降低建库成本,实现了简便、快速、灵敏、高效的RNA建库测序。TRACE技术可用于对鼻咽拭子、痰和粪便等样本的建库,使得临床样品中新型冠状病毒RNA基因组和共感染病原体宏基因组的检测更为便捷,有望在临床上为定制个性化诊疗策略提供帮助。

该项工作的开展离不开学校和国家的支持(“病毒基因组学测序技术在新型冠状病毒研究中的应用”)和团队协作。该应急项目还包括中国科学院武汉病毒研究所刘翟课题组和武汉希望组的成员。此外,南京诺唯赞生物科技有限公司为项目的顺利开展提供了关键试剂。目前,项目组已将该技术试用于临床样品的RNA文库构建和病毒检测,并将TRACE技术成功应用于首批病人咽拭子样品的宏基因组测序。伊成器课题组正在利用临床样品进一步优化TRACE技术,以快速实现更多临床样品的共感染病原体的检测和分析,为新冠感染者的临床诊治提供更多理论依据,助力疫情防控取得更多进展。

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